Die U2 wird in der Regel noch in der Klinik durchgeführt. Neben einer gründlichen allgemeinen körperlichen Untersuchung findet hier vor allem ein sogenanntes Neugeborenen-Screening (Bluttest auf angeborene Stoffwechselerkrankungen) statt. Dieser Test ist wichtig, da bei rechtzeitiger Behandlung schwerwiegende Folgen verhindert werden können. Außerdem werden die Rachitisprophylaxe mit Vitamin D und die Kariesprophylaxe mit Fluorid besprochen. Bei der U2 erhält das Kind auch Vitamin-K-Tropfen, um einer Blutgerinnungsstörung vorzubeugen. Zudem wird meist eine Gehörprüfung durchgeführt.